Suoliston merkkiaineet

Acinetobacter spp. on gramnegatiivisten bakteerien ryhmä, jota tavataan yleisesti maaperässä, vedessä ja joskus ihmiskehon suolistossa. Vaikka ne eivät yleensä ole hallitsevia terveessä mikrobiomissa, tietyt kannat saattavat asettua suolistoon, erityisesti antibioottien käytön jälkeen tai sairaalaympäristössä. Jotkut lajit, kuten Acinetobacter baumannii, ovat tunnettuja antibioottiresistenssistään ja roolistaan infektioissa, erityisesti immuunipuutteisilla henkilöillä. Ulosteen analyysissä Acinetobacterin esiintyminen voi viitata altistukseen ympäristölle, mikrobien epätasapainoon tai antibioottien aiheuttamiin muutoksiin suoliston mikrobistossa.

Akkermansia muciniphila on suolistobakteeri, joka tukee suolen limakalvon ylläpitoa ja tervettä suolinukkaa. Sitä yhdistetään hyödyllisiin aineenvaihduntaa ja immuunijärjestelmää koskeviin vaikutuksiin, ja se saattaa näytellä tärkeää roolia suoliterveydessä, painonhallinnassa ja yleisessä hyvinvoinnissa.

Alpha-1 antitrypsiini (AAT) on maksassa pääasiassa tuotettava proteiini, joka auttaa suojaamaan keuhkoja ja muita elimiä tulehdusta aiheuttavilta entsyymeiltä. AAT-tasojen mittaaminen ulosteesta voi auttaa suoliston proteiininhukkaa ja tulehdusta havaitsemisessa, mikä tukee suolistosairauksien, kuten tulehduksellisen suolistosairauden ja proteiinia menettävän enteropatian, diagnosointia.

Ammoniakki on typpipitoinen yhdiste, jota suolistossa muodostuu proteiinien ja aminohappojen hajoamisen kautta suolistobakteerien toimesta. Terveessä suolistossa suurin osa ammoniakista käytetään mikrobien toimesta tai se imeytyy ja eliminoidaan maksassa. Kohonneet ulosteen ammoniakkitasot voivat viitata liialliseen proteiinien fermentaatioon, suolistodysbioosiin tai hyödyllisten ja taudinaiheuttajien bakteerien epätasapainoon. Korkeat tasot voivat aiheuttaa limakalvon ärsytystä, tulehdusta ja heikentää suoliston esteen toimintaa. Ammoniakkitasot ovat hyödyllinen mittari mikrobisen proteiiniaineenvaihdunnan ja suoliston terveyden arvioinnissa.

Beetaglukuronidaasi on tiettyjen suoliston bakteerien tuottama entsyymi, joka voi katkaista sidoksen glukuronihapon sekä erilaisten maksassa poistettavaksi valmistettujen myrkkyjen, hormonien tai lääkkeiden välillä. Kohonnut beetaglukuronidaasin aktiivisuus ulosteessa saattaa viitata mikrobitasapainon häiriöön ja voi häiritä detoksifikaatiota aktivoimalla uudelleen aineita kuten estrogeeniä ja ksenobiootteja paksusuolessa. Tämä uudelleenaktivaatio voi myötävaikuttaa systeemiseen toksisuuteen tai hormonaalisiin epätasapaitoihin. Beetaglukuronidaasin mittaaminen ulosteessa auttaa arvioimaan mikrobimetaboliaa ja detoksifikaation tehokkuutta suolistossa.

Bilophila wadsworthii on gramnegatiivinen, anaerobinen, rikkiä pelkistävä bakteeri, jota esiintyy yleisesti ihmiskäärmissä pieninä määrinä. Se kykenee metaboloimaan sappihappoja ja pelkistämään rikkiyhdisteitä rikkivetykaasuksi (H₂S), joka liiallisina pitoisuuksina voi olla myrkyllistä suoliston epiteelisoluissa ja häiritä suoliston eheyttä. Kohonneet Bilophila wadsworthii -tasot on yhdistetty tulehduksellisiin sairauksiin, kuten koliittiin, ja ne voivat viitata dysbioottiseen suolistoympäristöön, erityisesti runsasrasvaisten tai runsaseläinproteiini-ruokavalioiden yhteydessä. Tätä bakteeria pidetään potentiaalisena patobionttina sen kyvyn vuoksi edistää tulehdusta tietyissä olosuhteissa.

Butyrivibrio spp. ovat hyödyllisiä suolistobakteereja, jotka tuottavat butyraattia, lyhytketjuista rasvahappoa, jolla on keskeinen rooli suoliston terveyden ylläpidossa. Butyraatti tukee suoliston limakalvon eheyttä, vähentää tulehdusta ja toimii tärkeimpänä energianlähteenä paksusuolen soluille. Butyrivibrion läsnäoloa pidetään yleisesti myönteisenä merkkinä terveestä mikrobistosta. Alhainen määrä voi viitata vähentyneeseen butyraatin tuotantoon, mikä voi liittyä suoliston tulehdukseen tai dysbioosiin. Nämä bakteerit kasvavat ravintokuidulla ja kuuluvat Firmicutes-heimoon.

Candida dubliniensis on hiivasieni, joka on läheistä sukua Candida albicansille ja voi olla osa normaalia mikrobiologista suoliston kasvistoa. Tietyissä olosuhteissa, kuten heikentyneen immuunijärjestelmän, dysbioosin tai runsaan sokerin saannin yhteydessä, se voi lisääntyä liiallisesti ja myötävaikuttaa sienitasapainon häiriöihin sekä ruoansulatuskanavan oireisiin. Se on harvinaisempi kuin C. albicans, mutta jakaa monia samankaltaisia piirteitä, kuten kyvyn muodostaa biofilmiä ja aiheuttaa limakalvotulehduksia. Sen pitoisuuden mittaaminen ulosteesta auttaa arvioimaan sieniylikasvua ja suoliston mykobioomin tasapainoa.

Candida glabrata on hiivasieni, joka voi luonnollisesti asustaa ihmisen ruoansulatus- ja virtsaputkistossa. Vaikka se on tavallisesti harmiton terveillä yksilöillä, se voi muuttua opportunistiseksi immuunipuutteisilla henkilöillä, mikä voi johtaa infektioihin. Verrattuna muihin Candida-lajeihin, C. glabrata on taipuvaisempi vastustamaan yleisiä sienilääkkeitä. Sen liikakasvu ulostenäytteissä voi viitata mikrobitasapainon häiriöön (dysbioosi), immuunivajaukseen tai aiempaan antibioottien käyttöön. Sen tason seuranta voi antaa tietoa suoliston yleisestä terveydestä ja alttiudesta sienikasvustolle.

Candida krusei on hiivasienilaji, joka voi olla osa suoliston mykoobioomia, mutta esiintyy yleensä vähäisinä määrinä. Se tunnetaan luonnollisesta resistenssistään tiettyjä sienilääkkeitä, erityisesti flukonatsolia, kohtaan, mikä tekee sen tunnistamisesta kliinisesti merkittävää. C. krusein liikakasvua voi esiintyä henkilöillä, joiden suolistofloora on heikentynyt, immuunijärjestelmässä on vajetta tai joilla on korkea sokerin saanti. Kohonneet pitoisuudet ulosteessa voivat heijastaa mikrobitasapainon häiriötä tai hiivan liikakasvutilaa, joka saattaa aiheuttaa ruoansulatusvaivoja ja systeemisiä oireita.

Candida lusitaniae on harvinaisempi hiivasieni, joka voi olla osa ihmisen normaalia mikrobistoa, mutta se on yhdistetty opportunistisiin infektioihin, erityisesti immuunijärjestelmältään heikentyneillä henkilöillä. Se on merkittävä mahdollisen resistenssinsä vuoksi tiettyjä sienilääkkeitä, erityisesti amfoterisiini B:tä vastaan. Ulosteanalyysissä C. lusitaniae:n esiintyminen voi viitata sieni-infektion liikakasvuun tai dysbioosiin, erityisesti suurina määrinä löytyessään. Sen havaitseminen on tärkeää suoliston mikrobiston tasapainon arvioimiseksi ja tarvittaessa jatkotutkimusten ohjaamiseksi.

Candida parapsilosis on hiivalaji, joka voi kuulua ihmisen normaaliin mikrobistoon, erityisesti iholla ja ruoansulatuskanavassa. Vaikka se on terveillä yksilöillä usein harmiton, se voi muuttua opportunistiseksi ja aiheuttaa infektioita, erityisesti sairaalahoidossa olevilla tai immuunipuutteisilla potilailla. Se liittyy yleisesti katetriin liittyviin infektioihin, haavatulehduksiin ja joskus ruoansulatuskanavan häiriöihin. Kohonneet pitoisuudet ulosteessa voivat viitata suoliston mikrobiston epätasapainoon, äskettäiseen antibioottien käyttöön tai heikentyneeseen immuunitoimintaan. Sen esiintymisen seuranta voi olla merkityksellistä sieni-infektion tai suoliston dysbioosin arvioinnissa.

Candida spp on rypäs hiivamaisia sieniä, jotka voivat vaikuttaa kehon eri osiin, mukaan lukien suolistoon ja emättimeen. Nämä sienet aiheuttavat usein oireita kuten kutinaa, epämukavuutta ja vuotoa, jotka johtuvat tyypillisesti kehon luonnollisen mikrobiston epätasapainosta. Suolistossa Candida spp voi häiritä ruoansulatusta, mikä johtaa turvotukseen ja muutoksiin suolen toiminnassa. Tekijät kuten ruokavalio, yleinen terveydentila ja antibioottien käyttö voivat edistää niiden liikakasvua, ja näihin tekijöihin puuttuminen on tärkeää tasapainon palauttamiseksi ja oireiden lievittämiseksi.

Candida tropicalis on hiivasieni, joka voi esiintyä osana normaalia ihmisen mikrobiotia, erityisesti suolistossa ja limakalvoilla. Sillä on suurempi taudinaiheutuspote ntiaali verrattuna joihinkin muihin ei-albicans Candida -lajeihin, ja se liittyy yleisesti systeemisiin infektioihin immuunivajavaisilla henkilöillä. Suolistossa kohonneet C. tropicalis -tasot voivat viitata sieniylikasvuun, dysbioosiin tai heikentyneeseen immuunijärjestelmään. Sen esiintyminen ulostetesteissä voi auttaa tunnistamaan suoliston mykoobion epätasapainotiloja sekä mahdollisia tulehduksen tai infektion lähteitä.

Citrobacter-lajit ovat joukko gramnegatiivisia bakteereja, jotka kuuluvat Enterobacteriaceae-heimoon. Niitä esiintyy yleisesti maaperässä, vedessä sekä ihmisten ja eläinten suolistossa. Vaikka jotkut lajit ovat normaalin suolistoflooran osia pieninä määrinä, kohonneet tasot voivat viitata dysbioosiin tai liikakasvuun. Tietyt lajit, kuten Citrobacter freundii, on yhdistetty ruoansulatushäiriöihin, virtsatieinfektioihin sekä sairaalainfektioihin haavoittuvilla henkilöillä. Ulostetutkimuksissa Citrobacterin esiintyminen voi heijastaa mikrobitasapainon häiriötä, immuunijärjestelmän stressiä tai aiempaa antibioottien käyttöä.

Coprococcus-suvun bakteerit ovat hyödyllisiä suoliston mikrobiomin bakteereja, jotka kuuluvat Firmicutes-tyyppisiin. Nämä mikrobit tunnetaan kyvystään tuottaa voihappoa, lyhytketjuista rasvahappoa, joka tukee suoliston läpäisevyyden eheyttä, säätelee tulehdusta ja edistää yleistä ruoansulatuksen terveyttä. Korkeammat Coprococcus-tasot liittyvät usein hyvin tasapainotettuun mikrobiomiin ja parantuneeseen mielenterveyteen, sillä voihappo voi vaikuttaa myös aivojen terveyteen suolisto-aivo-akselin kautta. Alhaiset tasot voivat viitata huonoon kuidun fermentaatioon, suoliston dysbioosiin tai tulehdukseen. Niiden esiintymistä pidetään yleisesti merkkinä terveellisestä, kuitupitoisesta ruokavaliosta.

D-arabinitoli on sokerialkoholi, jota käytetään biologisena indikaattorina kehossa Candida-infektioiden havaitsemiseksi. Kohonneet D-arabinitolitason arvot viittaavat usein Candida-mikrobikasvuston liikakasvuun, erityisesti immuunipuutteisilla henkilöillä. D-arabinitolin mittaaminen tarjoaa nopeamman ja vähemmän invasiivisen tavan diagnosoida systeeminen kandidoosi verrattuna perinteisiin viljelymenetelmiin.

Desulfomonas pigra on sulfaatinpelkistäjäbakteerien (SRB) laji, jota esiintyy anaerobisissa ympäristöissä, mukaan lukien ihmisen suolistossa. Se osallistuu rikin aineenvaihduntaan pelkistämällä sulfaattia rikkivetyksi (H₂S). Vaikka rikkivety on paksusuolessa luonnostaan esiintyvä yhdiste, SRB-bakteerien kuten D. pigran tuottamat kohonneet määrät voivat häiritä suoliston esteen toimintaa ja edistää ruoansulatuskanavan tulehdusta tai epämukavuutta. Desulfomonas pigran lisääntynyt esiintyvyys voi viitata rikinpelkistäjämikrobien liikakasvuun, mikä voi liittyä rikkiä sisältävien ruokien runsaisiin määriin tai suolistomikrobiston epätasapainoon.

Desulfovibrio piger on yleinen sulfaattia pelkistävä bakteeri (SRB) ihmisen suoliston mikrobiotassa. Se pelkistää sulfaattia ja muita rikkiyhdisteitä vetykeräkaasuksi (H₂S), joka pieninä määrinä on fysiologisesti merkityksellinen, mutta liiallisena voi olla myrkyllistä suoliston soluille. D. pigerin kohonnut määrä on yhdistetty ruoansulatuskanavan sairauksiin, kuten tulehdukselliseen suolistosairauteen (IBD) ja ärtyvän suolen oireyhtymään (IBS). Sen runsaus voi heijastaa lisääntynyttä rikin saantia ravinnon kautta tai mikrobiotas tasapainon häiriötä, joka suosii rikkimetaboliaa.

Diamine oksidaasi (DAO) on entsyymi, joka auttaa hajottamaan histamiinia, yhdistettä, joka osallistuu immuunitoimintoihin, ruoansulatukseen ja hermoston toimintaan. Terveet DAO-tasot ovat tärkeitä histamiinibalanssin säätelyssä ja histamiiniallergian riskin vähentämisessä.

Dysbioosi-indeksi on mittari, jota käytetään suoliston mikrobiston epätasapainon arvioimiseen, mikä osoittaa dysbioosin esiintymisen ja vakavuuden. Se kvantifioi mikrobien monimuotoisuuden ja koostumuksen poikkeamat verrattuna terveeseen vertailuväestöön. Korkeampi indeksi viittaa suurempaan dysbioosiin, joka voi liittyä terveysongelmiin, kuten tulehdukseen, ruoansulatushäiriöihin tai aineenvaihduntasairauksiin.

Enterotyypit ovat ihmisen suoliston mikrobiston luokituksia, jotka perustuvat hallitseviin bakteeriryhmiin ja niiden aineenvaihdunnallisiin toimintoihin. On olemassa kolme pääasiallista enterotyyppiä: Bacteroides-valtainen (Tyyppi 1), Prevotella-valtainen (Tyyppi 2) ja Ruminococcus-valtainen (Tyyppi 3). Jokaisella tyypillä on ainutlaatuiset ominaisuudet siinä, miten ravintoaineita kuten rasvoja, hiilihydraatteja ja proteiineja metaboloidaan. Esimerkiksi Prevotella (Tyyppi 2) hyödyntää hiilihydraatteja tehokkaammin, erityisesti kuitupitoisissa ruokavalioissa, mutta on vähemmän kykenevä syntetisoimaan tiettyjä vitamiineja. Enterotyyppisi voi vaikuttaa ravintoaineiden imeytymiseen, suoliston terveyteen ja siihen, miten kehosi reagoi erilaisiin ruokavalioihin.

Equol on yhdiste, jota suolistobakteerit tuottavat soijan isoflavoni daidzeinin aineenvaihdunnan aikana. Se toimii ei-steroidisena estrogeenina ja voi tarjota erilaisia terveyshyötyjä, kuten antioksidanttisia ja hormonitasapainoa ylläpitäviä vaikutuksia. Kuitenkin vain osalla ihmisistä on suolistossaan tiettyjä bakteereja, jotka pystyvät tuottamaan equolia. Equolin mittaaminen ulosteesta auttaa selvittämään, kykeneekö suolistomikrobiomi muuntamaan daidzeinin tehokkaasti, tarjoten tietoa mikrobiomin monimuotoisuudesta ja toiminnasta estrogeenin aineenvaihduntaan liittyen.

Erittyvän IgA:n (sIgA) taso heijastaa tärkeän immuuniproteiinin Immunoglobuliini A:n määrää, jota esiintyy pääasiassa limakalvoalueilla, kuten suolistossa, hengitysteissä ja syljessä. Erittyvä IgA näyttelee keskeistä roolia kehon ensimmäisen puolustuslinjan toiminnassa sitoutumalla taudinaiheuttajiin ja estämällä niiden pääsyn, mikä auttaa suojaamaan limakalvoja sekä tukemaan yleistä immuunijärjestelmän ja suoliston terveyttä.

Eubacterium-lajit muodostavat monimuotoisen anaerobisten bakteerien ryhmän, joita esiintyy ihmisen suolistossa ja jotka kuuluvat Firmicutes-tyyppikuntaan. Monet tämän suvun lajit edistävät suoliston terveyttä tuottamalla lyhytketjuisia rasvahappoja (SCFA), erityisesti butyraattia. Nämä yhdisteet ravitsevat paksusuolen soluja, tukevat immuunijärjestelmää ja vähentävät tulehdusta. Jotkin lajit saattavat myös osallistua sappihappojen aineenvaihduntaan ja vitamiinien synteesiin. Eubacterium-populaatioiden epätasapaino voi liittyä dysbioosiin tai kroonisiin ruoansulatuskanavan sairauksiin.

Faecalibacterium prausnitzii (F. prausnitzii) on avainhyödyllinen bakteeri ihmisen suolistossa, joka tunnetaan tulehdusta ehkäisevistä vaikutuksistaan. Se näyttelee tärkeää roolia suoliston terveyden ylläpitämisessä tukemalla tasapainoista mikrobiomia ja vahvistamalla suoliston suojakerrosta.

Fenolit ovat orgaanisia yhdisteitä, joita suolistobakteerit voivat tuottaa tiettyjen aminohappojen, erityisesti tyrosiinin, käymisprosessin aikana. Jotkut fenolit, kuten p-kresoli, voivat suurina pitoisuuksina olla myrkyllisiä ja liittyä dysbioosiin eli suoliston mikrobiston epätasapainoon. Kohonneet fenolitasot ulosteessa voivat heijastaa mikrobitoimintaa, joka saattaa rasittaa maksan detoksifikaatiojärjestelmiä. Fenolien seuranta auttaa arvioimaan, kuinka hyvin suolisto hallitsee proteiinien hajoamista ja mikrobien käymisprosesseja.

Firmicutes on yksi ihmisen suoliston mikrobiomin pääbakteeriryhmistä, johon kuuluu monia lajeja, jotka osallistuvat energian talteenottoon ruoasta. Nämä bakteerit ovat tehokkaita hajoittamaan monimutkaisia hiilihydraatteja ja tuottamaan lyhytketjuisia rasvahappoja, jotka voivat edistää suoliston ja aineenvaihdunnan terveyttä. Joissakin tutkimuksissa on kuitenkin havaittu, että Firmicutesin ja Bacteroidetesin epäsuhta on yhteydessä lihavuuteen ja aineenvaihdunnan häiriöihin. Firmicutesin tasapaino on siksi tärkeä indikaattori mikrobi-diversiteetin arvioinnissa sekä mahdollisten aineenvaihdunnallisten taipumusten tunnistamisessa. Yksilölliset terveysvaikutukset riippuvat kokonaiskoostumuksesta ja isännän tekijöistä.

Fusobacterium on anaerobisten, gramnegatiivisten bakteerien suku, jota esiintyy luonnollisesti ihmisen suuontelossa, ruoansulatuskanavassa ja joskus myös emättimen kasvistossa. Vaikka jotkut lajit voivat olla osa normaalia mikrobistoa, Fusobacterium tunnetaan myös tulehduksiin ja infektioihin liittyvänä bakteerina. Korkeat pitoisuudet suolistossa on yhdistetty sairauksiin kuten tulehduksellinen suolistosairaus (IBD) ja paksusuolen syöpä. Sen esiintyminen nähdään usein merkkinä mikrobikannan epätasapainosta tai patogeenisestä liikakasvusta, erityisesti kun se havaitaan yhdessä oireiden, kuten turvotuksen tai suoliston toimintojen muutosten kanssa.

Geotrichum candidum on sienilaji, jota tavataan yleisesti ympäristössä, mukaan lukien maaperässä, vedessä, ilmassa ja tietyissä elintarvikkeissa. Se on myös luonnollinen osa ihmisen mikrobiotaa, ja esiintyy tyypillisesti suolistossa ja iholla. Vaikka se on yleensä haitaton, se voi hyödyntää tilaisuuden ja aiheuttaa infektioita heikentyneen immuunijärjestelmän omaavilla henkilöillä.

Haiman elastraasi on haiman tuottama entsyymi, joka on keskeisessä roolissa proteiinien ruoansulatuksessa. Sen pitoisuuden mittaaminen ulosteesta voi tarjota tärkeitä tietoja haiman toiminnasta. Koska entsyymi säilyy vakaana ulosteemateriaalissa, se toimii luotettavana merkkiaineena haiman eksokriinisen toiminnan arvioinnissa, erityisesti haiman vajaatoiminnan diagnosoinnissa.

Hiiva on eräs sienen muoto, joka esiintyy luonnollisesti ihmiskehossa, erityisesti suolistossa ja iholla. Tavallisina määrinä se on haitaton ja osa tervettä mikrobiomia. Epätasapaino voi kuitenkin johtaa liikakasvuun, mikä saattaa aiheuttaa erilaisia terveysongelmia. Tekijät kuten ruokavalio, antibioottien käyttö ja yleinen terveydentila voivat vaikuttaa hiivan määrään.

Histamiini (ulosteessa) on diagnostinen merkki, jota käytetään ruoansulatuskanavan allergisen ja tulehduksellisen aktiivisuuden arviointiin. Histamiini on immuunisolujen erittämä biogeeninen amiini, joka vapautuu allergeenien vaikutuksesta ja jolla on keskeinen rooli tulehduksessa. Kohonneet histamiinitasot ulosteessa voivat viitata esimerkiksi ruoka-aineallergioihin, tulehduksellisiin suolistosairauksiin (IBD) tai syöttösolujen aktivoitumiseen, ja ne auttavat ohjaamaan kyseisiin immuunivasteisiin liittyvää diagnoosia ja hoitoa.

Histamiinia tuottavat bakteerit ovat suoliston mikro-organismeja, jotka pystyvät muuttamaan aminohappo histidiinin histamiiniksi, biogeeniseksi aminoksi, jolla on keskeinen rooli immuunivasteissa ja allergisissa reaktioissa. Vaikka histamiini on välttämätön viestintämolekyyli, liiallinen tuotanto suolistossa voi aiheuttaa allergioita muistuttavia oireita, kuten ihottumaa, päänsärkyä tai ruoansulatusvaivoja. Nämä bakteerit voivat lisääntyä kroonisen stressin, heikentyneen suoliston esteen toiminnan tai histidiinirikkaita ruokia sisältävien ruokavalioiden seurauksena. Kohonneet tasot liittyvät sellaisiin tiloihin kuin histamiinintoleranssi tai pseudoallergiat. Tasapainoisen mikrobiston ylläpitäminen ja suoliston esteen asianmukainen eheys voivat auttaa vähentämään mikrobiperäistä histamiinikuormaa.

Indoksyyli sulfaaatti on uremiatoksiini, joka muodostuu, kun suolistobakteerit metaboloivat aminohappo tryptofaanin indoliksi, joka imeytyy ja muuttuu maksassa indoksyyli sulfaatiksi. Pieniä määriä erittyy normaalisti munuaisten kautta, mutta kohonneet pitoisuudet voivat viitata heikentyneeseen detoksifikaatioon, dysbioosiin tai munuaisten rasitukseen. Indoksyyli sulfaatilla on yhteys oksidatiiviseen stressiin, systeemiseen tulehdukseen ja verisuonten toimintahäiriöihin—erityisesti henkilöillä, joilla on heikentynyt munuaistoiminta. Se toimii sekä mikrobitoiminnan että kehon kyvyn tunnisteena käsitellä ja poistaa aineenvaihdunnan jätteitä.

Kalprotektiini on valkosoluissa esiintyvä proteiini, joka toimii tulehduksen merkkinä, erityisesti suolistossa. Kalprotektiinitasojen mittaaminen ulosteesta auttaa arvioimaan suoliston tulehduksen määrää. Tämä testi on hyödyllinen tulehduksellisten suolistosairauksien (IBD), kuten Crohnin taudin ja haavaisen paksusuolitulehduksen, diagnosoinnissa ja seurannassa sekä niiden erottamisessa ärtyvän suolen oireyhtymästä (IBS), joka tyypillisesti ei nosta kalprotektiinitasoja.

Metaanihengitystesti on diagnostinen menetelmä, joka mittaa suolistobakteerien tuottaman metaanikaasun määrää. Metaania syntyy tietyissä suolistomikrobeissa tiettyjen hiilihydraattien hajoamisen aikana. Kohonneet metaanipitoisuudet hengitystesteissä liittyvät muun muassa tiloihin kuten ohutsuolen bakteerien liikakasvu (SIBO), fruktoosi-intoleranssi ja sorbitoli-intoleranssi, jotka voivat aiheuttaa oireita kuten turvotusta, ummetusta, vatsakipua ja suoliston toiminnan muutoksia.

Methanobrevibacter-lajit ovat arkeoneja — mikro-organismeja, jotka eroavat bakteereista ja jotka asuttavat pääasiassa ihmisen suolistoa. Näiden mikrobien tiedetään tuottavan metaanikaasua käymisprosessin sivutuotteena, erityisesti vedystä ja hiilidioksidista. Kohonneet Methanobrevibacter-suvun tasot on yhdistetty hidastuneeseen suoliston kulkuun sekä oireisiin kuten ummetukseen ja turvotukseen. Toisin kuin monet bakteerit, arkeonit eivät ole standardi-antibioottien vaikutuksen alaisia, mikä tekee niiden liikakasvun hallinnasta monimutkaisempaa. Niiden esiintyminen tarjoaa tietoa suolistomikrobiyhteisöjen tasapainosta ja kaasun tuotannosta suolistossa.

Monimuotoisuus viittaa suoliston mikrobiomissa esiintyvien bakteerilajien moninaisuuteen. Korkeampi mikrobiinimonimuotoisuus liittyy yleisesti parempaan ruoansulatusterveyteen, immuunitoimintaan ja vastustuskykyyn taudinaiheuttajia vastaan. Matala monimuotoisuus puolestaan saattaa olla yhteydessä tulehdukseen, heikkoon ravinteiden imeytymiseen ja erilaisiin kroonisiin sairauksiin.

Morganella-lajit, erityisesti Morganella morganii, ovat gramnegatiivisia bakteereja, jotka kuuluvat Enterobacteriaceae-heimoon. Ne luokitellaan tilapäisiksi taudinaiheuttajiksi ja niitä esiintyy ajoittain ihmisen suolistossa osana normaalia mikrobistoa. Kuitenkin kohonneet määrät ulosteessa voivat viitata dysbioosiin tai mahdolliseen infektion riskiin, erityisesti immuunipuutteisten henkilöiden kohdalla. Morganella tunnetaan myös biogeenisten amiinien, kuten putresciinin ja kadaveriinin, tuotannosta, jotka voivat vaikuttaa suoliston ja koko elimistön oireisiin. Klinikkaolosuhteissa Morganella morganii on yhdistetty virtsatieinfektioihin ja muihin sairaalaperäisiin infektioihin.

Fekaalinen piilevä veri (FOB) on mittaus, joka havaitsee silmämääräisesti näkymättömän veren ulosteessa. FOB:n esiintyminen voi olla tärkeä merkki sisäisestä ruoansulatuskanavan verenvuodosta, joka usein ilmenee ilman ilmeisiä oireita. FOB-testi on invasiivinen menetelmä, jota käytetään auttamaan mahdollisten ruoansulatuskanavaa koskevien taustalla olevien sairauksien tunnistamisessa.

Ulosteen pH-arvo on mitta, joka osoittaa suoliston happamuuden tai emäksisyyden. Se heijastaa aineenvaihduntaprosessien, kuten fermentaation ja proteiinien hajoamisen, tasapainoa. Matala ulosteen pH viittaa usein suolistobakteerien lisääntyneeseen monimutkaisten sokerien fermentaatioon, mikä voi happamoittaa ulostetta. Toisaalta korkea ulosteen pH saattaa johtua liiallisesta proteiiniaineenvaihdunnasta, mikä johtaa ammoniakin ja muiden yhdisteiden muodostumiseen, jotka nostavat ulosteen pH-tasoa.

Proteobakteerit ovat suuri gramnegatiivisten bakteerien pääjakso, joka sisältää sekä harmittomia kommensaalisia lajeja että mahdollisia taudinaiheuttajia. Suolistossa pieni määrä proteobakteereja voi olla normaalia, mutta kohonneita määriä pidetään usein dysbioosin ja tulehduksen merkkinä. Tämä ryhmä sisältää lajeja kuten Escherichia, Salmonella, Helicobacter ja Klebsiella, joista jotkut liittyvät ruoansulatuskanavan sairauksiin, infektioihin ja aineenvaihdunnan häiriöihin. Proteobakteerien lisääntynyt esiintyvyys voi heijastaa mikrobiston epävakautta tai suolen tulehdusta edistävää ympäristöä.

Providencia-suvun bakteerit ovat gramnegatiivisia, fakultatiivisesti anaerobisia bakteereja, jotka kuuluvat Enterobacteriaceae-heimon joukkoon. Ne eivät tyypillisesti ole suoliston mikrobiston hallitsevia jäseniä, mutta niitä voidaan löytää pieninä määrinä. Jotkin lajit, kuten Providencia stuartii ja Providencia rettgeri, luokitellaan opportunistisiksi taudinaiheuttajiksi, ja ne on yhdistetty virtsatieinfektioihin sekä ruoansulatushäiriöihin. Kohonneet pitoisuudet ulostenäytteessä voivat viitata mikrobiston epätasapainoon (dysbioosiin) tai mahdollisesti patogeenisten kantojen liikakasvuun. Providencia-lajit tunnetaan myös uretaasin tuottokyvystään ja niiden osallistumisesta ammoniakin muodostumiseen.

Ulosteen rasvamääritys on diagnostinen testi, joka mittaa ulostenäytteissä erittyvän rasvan määrää. Sitä käytetään rasvan imeytymisen arvioimiseen ja imeytymishäiriöiden havaitsemiseen. Kohonneet rasvapitoisuudet ulosteessa, eli steatorrea, voivat viitata ruoansulatus- tai imeytysongelmiin ruoansulatuskanavassa. Tämä testi auttaa diagnosoimaan sairauksia, kuten haiman vajaatoimintaa, kystistä fibroosia, keliakiaa ja Crohnin tautia.

Roseburia-suvun bakteerit ovat hyödyllisiä anaerobisia bakteereja, jotka kuuluvat Firmicutes-heimoon ja ovat yleisiä terveiden ihmisten suoliston asukkeja. Näille bakteereille on ominaista kyky tuottaa butyraattia, lyhytketjuista rasvahappoa, joka toimii tärkeänä energianlähteenä paksusuolen soluissa ja auttaa vähentämään suoliston tulehdusta. Tasapainoinen Roseburia-taso liittyy usein parempaan aineenvaihdunnalliseen terveyteen, suoliston suojakerroksen parantuneeseen toimintaan sekä matalampaan riskiin tulehduksellisten sairauksien osalta. Alentuneet tasot on yhdistetty esimerkiksi lihavuuteen, tyypin 2 diabetekseen ja tulehduksellisiin suolistosairauksiin.

Ruminococcus spp. ovat anaerobisten bakteerien ryhmä Firmicutes-heimossa, joita esiintyy yleisesti ihmisen suolistomikrobistossa. Ne näyttelevät merkittävää roolia monimutkaisten hiilihydraattien käymisprosessissa sekä lyhytketjuisten rasvahappojen, kuten asetaatin ja butyraatien, tuotannossa, jotka tukevat suoliston terveyttä ja energiava vaihtoa. Ruminococcus-lajit katsotaan tärkeiksi tasapainoisen suolistoympäristön ylläpitämisessä, erityisesti niiden kuituja pilkkovien kykyjen vuoksi. Ruminococcus-kantojen muutokset on yhdistetty ruoansulatusongelmiin, ärtyvän suolen oireyhtymään (IBS) ja aineenvaihdunnan häiriöihin.

Sappihapot ovat rasvojen sulattamiseksi välttämättömiä yhdisteitä, joita maksa tuottaa ja varastoi sappihaimassa. Vaikka suurin osa niistä imeytyy uudelleen elimistöön, osa erittyy ulosteeseen. Sappihappojen mittaaminen ulosteessa auttaa arvioimaan ruoansulatusjärjestelmän terveyttä, erityisesti rasvojen imeytymishäiriöiden ja niihin liittyvien sairauksien diagnosoinnissa.

Kvantitatiivinen ulosteen sokeritesti on diagnostinen työkalu, joka mittaa tiettyjen sokereiden määrää ulosteessa arvioidakseen hiilihydraattien imeytymishäiriöitä. Se auttaa tunnistamaan esimerkiksi laktoosi-intoleranssin, fruktoosi-intoleranssin ja muut sokerien pilkkumista ja imeytymistä haittaavat häiriöt. Havaitsemalla pilkkoutumattomia sokereita, kuten laktoosia, fruktoosia tai sorbitolia ulosteesta, testi auttaa terveydenhuollon ammattilaisia selvittämään, mitkä sokerit ruoansulatusjärjestelmässä hankaloittavat, mikä usein liittyy oireisiin kuten turvotus, kaasunmuodostus, ripuli ja vatsakipu.

Trimetyyliamiini (TMA) on suolistobakteerien tuottama metaboliitti, joka syntyy koliinin, karnitiinin ja lesitiinin hajoamisen yhteydessä – ravintoaineiden, joita esiintyy yleisesti lihassa, munissa ja maitotuotteissa. Maksassa TMA muuttuu trimetyyliamiini N-oksidiksi (TMAO), yhdisteeksi, joka on useissa tutkimuksissa yhdistetty sydän- ja verisuoniriskiin. Kohonneet TMA/TMAO-pitoisuudet voivat heijastaa suoliston mikrobien aktiivista muuntumista, epätasapainoista mikrobiotia tai eläinperäisten tuotteiden runsasta ruokavaliota. Vaikka tutkimus jatkuu, korkea TMAO on yhdistetty tulehdukseen ja häiriintyneeseen kolesteroliaineenvaihduntaan. Tasapainoinen suolistofloora ja kasvispainotteiset ruokavaliot voivat auttaa ylläpitämään terveitä TMAO-tasoja.

Toissijaiset sappihapot muodostuvat paksusuolessa bakteerien muuntaessa maksassa alkujaan syntetisoituja ensisijaisia sappihappoja. Vaikka niillä on rooli ruoansulatuksessa ja mikrobien säätelyssä, kohonneet pitoisuudet voivat viitata dysbioosiin, liialliseen rasvan saantiin tai muuttuneeseen sappihappoaineenvaihduntaan. Jotkut toissijaiset sappihapot, kuten deoksykoolihappo (DCA) ja litokoolihappo (LCA), on liitetty limakalvon ärsytykseen, tulehdukseen ja lisääntyneeseen suoliston sairauksien riskiin, kun niiden pitoisuudet pysyvät pitkään koholla. Niiden mittaaminen ulosteesta auttaa arvioimaan suoliston mikrobitoimintaa ja sappihappojen detoksifikaatiotilaa.

Typpimäärityksen (N) kvantitatiivinen määritys on laboratoriotesti, joka mittaa typen pitoisuuksia kehon eritteissä, yleensä virtsassa tai ulosteessa, arvioidakseen proteiinin pilkkoutumista ja imeytymistä. Tämä testi on olennainen ravitsemustilan arvioinnissa, erityisesti kliinisissä ympäristöissä, joissa proteiini-energian puutostilat tai epätasapainot voivat olla huolenaihe. Se tarjoaa keskeisiä näkemyksiä proteiinin aineenvaihduntaan liittyvistä metabolistisista toiminnoista ja voi auttaa diagnosoimaan proteiinin aineenvaihduntaa vaikuttavia sairauksia, kuten munuaistauteja, imeytymishäiriöitä ja tiettyjä aineenvaihdunnallisia häiriöitä.

Ulosteen vesipitoisuuden analyysi on testi, joka mittaa ulosteessa olevan veden määrää. Tämä arviointi on tärkeä diagnosoitaessa ruoansulatuskanavan epänormaaliin veden imeytymiseen tai eritykseen liittyviä tiloja. Se auttaa tunnistamaan ripulin syitä, jotka voivat johtua infektioista, tulehduksellisista suolistosairauksista (IBD), ärtyvän suolen oireyhtymästä (IBS) tai imeytymishäiriöistä, joissa suolistossa esiintyy joko liiallista veden eritystä tai riittämätöntä imeytymistä.

Vetyhengitystesti on diagnostiikkamenetelmä, joka mittaa hengityksessä esiintyvän vedyn määrää. Vetyä tuottavat suolistobakteerien käymisprosessit suolistossa. Tätä testiä käytetään yleisesti tunnistamaan sairauksia, kuten ohutsuolen bakteerien liikakasvua (SIBO), fruktoosin sietämättömyyttä ja sorbitolin sietämättömyyttä. Kohonneet vetyarvot viittaavat siihen, että sulamattomia hiilihydraatteja käyvät bakteerit fermentoimassa suolistossa, mikä saattaa aiheuttaa oireita kuten turvotusta, ripulia ja vatsavaivoja.

Zonuliini on proteiini, joka säätelee tiiviiden liitosten läpäisevyyttä suoliston soluissa. Se näyttelee keskeistä roolia suoliston suojakerroksen ylläpidossa hallitsemalla aineiden, kuten ravinteiden ja antigeenien, kulkua suolistosta verenkiertoon. Zonuliinitasojen epätasapaino voi vaikuttaa suoliston läpäisevyyteen ja siten mahdollisesti edistää erilaisia terveysongelmia.